中的—
$%—和—
&’—均形成氫鍵,以增加
!折疊的穩(wěn)定性。
!
!氮吹儀廠家折疊中并行的兩條肽段的走向可相同
(稱為順向平行)或相反(稱為反向平行)(圖
!")。反向平行肽段的間距為
()*
+,。"側(cè)鏈
-基團(tuán)交
替地分布于
!折疊鋸齒平面的上、下方。
##(/)!轉(zhuǎn)角
#多肽鏈中肽段出現(xiàn)
.0(1回折時的結(jié)構(gòu)稱為
!
轉(zhuǎn)角或
!回折(!
234+或
!
56+7)。!轉(zhuǎn)角多由
8個氨基酸殘
基組成,第二個氨基酸殘基多為脯氨酸,其他常見的有甘氨酸
等。第
.個氨基酸的羧基氧與第
8個氨基酸的氨基氫形成氫
鍵,以維系
!轉(zhuǎn)角的穩(wěn)定性(圖
!
.()。
##(8)無規(guī)卷曲
#多肽鏈的主鏈構(gòu)象除上述
/種外,還存在
一些似乎無確定規(guī)律可循的折疊方式,它們被稱為無規(guī)卷曲
(49+7:,
;:<=)。無規(guī)卷曲也是蛋白質(zhì)分子中一種不可缺少的構(gòu)
象規(guī)律(圖
!
..)。
#
#/)模體
##在一些蛋白質(zhì)分子中,常發(fā)現(xiàn)幾個(多為
!
>/個)具有二
級結(jié)構(gòu)的肽段相互靠近,形成具有特定功能的空間構(gòu)象;或者僅
是一個具有特定功能的很短的肽段。這種結(jié)構(gòu)稱為模體(
,:?
2<@)。有人將具有二級結(jié)構(gòu)的幾個肽段所構(gòu)成的模體稱為超二
級結(jié)構(gòu)(A3B64
A6;:+794C
A243;2346),常見的有螺旋轉(zhuǎn)角螺旋模
體、
鋅指模體等。
##螺旋轉(zhuǎn)角螺旋(D6==.-4)。圖
!
"%顯示細(xì)胞癌基因
$%&表達(dá)的
?,2蛋白的結(jié)構(gòu)域。
?,2含
?$!、?$;和蛋白激
酶三個結(jié)構(gòu)域。
?$!和
?$;可以分別識別蛋白質(zhì)的相應(yīng)肽段,蛋白激酶結(jié)構(gòu)域具有蛋白激酶活性(見第
十九章
#細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo))。
##(三)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)
##許多蛋白質(zhì)含有兩條以上具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈,這些多肽鏈通過非共價鍵相互連接形成的多
聚體結(jié)構(gòu)稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)(
@1.*+,4.,/
0*,12*1,+)。每條具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈則稱為此蛋白
圖
!
"!#
$)$模體結(jié)構(gòu)
第二章
$蛋$白$質(zhì)"!
圖
!
"#$鋅指模體結(jié)構(gòu)
圖
!
"%$細(xì)胞癌基因
!"#表達(dá)產(chǎn)物
&’(的結(jié)構(gòu)展開圖
質(zhì)的亞基()*+*,-.)。所以,蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)也可以認(rèn)為是蛋白質(zhì)分子中各亞基間的空間排布。穩(wěn)定蛋
白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵是氫鍵、離子鍵、疏水作用和范德華力等非共價鍵。血紅蛋白由四個亞基組成,具
有四級結(jié)構(gòu)(圖
!
"/)。一般認(rèn)為,具有四級結(jié)構(gòu)的
蛋白質(zhì),單獨
的亞基無生物活性,只有具有完整的四
級結(jié)構(gòu)才有活性。胰島素雖然含有兩條多肽鏈,但兩
多肽鏈之間以
!條二硫鍵相連,所以胰島素不具有四
級結(jié)構(gòu)。
$$(四)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的確定
$$分析蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)比分析蛋白質(zhì)的一級結(jié)
構(gòu)復(fù)雜得多。當(dāng)前測定蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的主要技術(shù)
是
0線晶體分析(1
’23
(’3).24456’2783)和核磁共振
光譜分析(
,*(492’
:26,9.-(
’9)5,2,(9[
;<=])79(>
.’5)(573)。到
!?世紀(jì)末,已經(jīng)確定了一萬余種蛋白
質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)。
圖
!
"/$血紅蛋白的四級結(jié)構(gòu)
"!第一篇
!生物分子的結(jié)構(gòu)與功能